ООО «НовоморНИИпроект» имеет свидетельства о допуске к следующим видам работ, которые оказывают влияние на безопасность объектов капитального строительства, включая особо опасные, технически сложные и уникальные объекты, в том числе морские порты:
- проектные работы
- выполнение инженерных изысканий
ООО «НовоморНИИпроект» имеет лицензию ФСБ на осуществление работ с использованием сведений, составляющих государственную тайну.
С 2006 года проектный институт «ООО НовоморНИИпроект» имеет сертификат соответствия системы менеджмента качества ИСО 9001. В настоящее время система менеджмента качества Института сертифицирована Сертификационным обществом «Русский регистр» на соответствие стандарту ISO 9001:2015